自古以來，旱澇、風蝗、地震、海嘯各種災害往往都會增加疫病暴發(fā)或流行的機會，歷史上繼發(fā)于災荒之后的疫病屢見不鮮，所謂“大兵之后，必有兇年；大荒之后，必有大疫”。據(jù)文獻記載，漢唐以來，尤其是明清之際，蘇州及鄰近地區(qū)先后發(fā)生過數(shù)百次的疫病流行。明代二百七十六年中有六十四次疫病流行，清代二百九十五年中大小疫病流行不下三百多次。由于干旱、水澇、海嘯等災害摧毀了城鎮(zhèn)村落，生活環(huán)境惡化，飲水被污染，淹溺、受傷、凍餒及病死的人畜眾多，尸體淺埋處理或暴尸荒野道旁，形成污染源，造成了疫病流行的條件。

東漢時河南張仲景亦曾痛感建安以來疫病的流行，他的家族原有二百多人，然而未滿十年，卻死去了三分之二，其中死于傷寒病的就有七十人。于是他“感往昔之淪喪，傷橫夭之莫救，乃勤求古訓，博采眾方”，寫成《傷寒論》一書。

傷寒病是一切外感熱性病的總稱，以傷寒病命名，列治法三百九十七條，組方一百一十三首，用藥九十七味，歷經(jīng)千百年，中醫(yī)藉此治病，屢治不爽。

溫病學說和傷寒學說不同，它形成的年代較晚。在《黃帝內(nèi)經(jīng)》雖然也提到了溫病，比如《素問?生氣通天論》中說：“冬傷于寒，春必病溫”，《素問?陰陽應象大論》中又說：“冬傷于寒，春必溫病”。這兩篇提到的溫病，雖未提及具體的形成原因，但也給后世對伏氣溫病的研究奠定了基礎。

溫病學說形成的時期應該說是清代的中期，到現(xiàn)在也就200多年，是經(jīng)過無數(shù)醫(yī)學家的不斷努力才逐步形成完整的學術體系。由于醫(yī)家們的思想受到“尊經(jīng)崇古”觀念的束縛，不敢直面溫病，只是強調(diào)了溫病與傷寒的不同，企圖避免和《傷寒論》的直接矛盾，所以溫病學說發(fā)展得非常緩慢。

溫病學派理論體系的創(chuàng)立者——葉天士

清初以后，溫病學說日趨成熟，直至葉天士《溫熱論》的問世，完善了溫病學說理論體系，確立和推動了吳中溫病學派的誕生。

“溫邪則熱變最速”。葉天士認為溫熱病邪是熱邪，侵犯體表腠理是開泄的，它可以很快入里，沒有流戀體表的過程，所以傳便很快。溫病由表入里后有兩種傳變趨勢，一種是逆?zhèn)餍陌鼱I分，消耗血中津液；在一種是順傳陽明氣分，變成里熱證。同時葉桂還制訂了“在衛(wèi)汗之可也，到氣才可清氣……入血就恐耗血動血，直須涼血散血”的治療原則，廣泛應用于溫病臨床。在溫病的診斷方法上他發(fā)明了察舌、驗齒、辨別斑疹等體征，并且有較詳細的記錄和總結，對當時醫(yī)家診斷疾病提供了寶貴經(jīng)驗。

溫病學派中成藥開創(chuàng)者——雷允上  

雷允上作為葉天士的同門師弟，均師承王子接（晉三）門下，在醫(yī)藥學術上受葉天士影響較大，葉天士在辨證診治方面確立了溫病學說的診斷法則，雷允上不僅精通醫(yī)道，更擅長修合丸散膏丹，主攻時疫急救藥及以道地藥材為原料的常見、多發(fā)病的治療藥，在諸多江南大疫中發(fā)揮了重要的作用，“一時為民所重”，名聲鵲起，成為姑蘇名醫(yī)。而雷允上國家級保密產(chǎn)品六神丸就是吳門溫病學派治病用藥的經(jīng)典體現(xiàn)。雷允上著有《金匱辨證》、《要癥方略》、《經(jīng)病方論》、《丹丸方論》等典籍。由于醫(yī)術高明,治病有方，名聲遍聞蘇州，蜚聲杏林。